阿卡斑病毒（Akabane vrius, AKAV）是阿卡斑病（又称赤羽病）病原，该病是一种虫媒性传染病，可导致牛、羊流产、死胎、胎儿畸形，并通过垂直传播，侵害胎儿中枢神经，造成积水性无脑综合症和新生胎儿关节弯曲；主要流行于热带、亚热带及温带地区，如亚洲、非洲的部分国家和大洋洲，并在我国多省广泛流行，严重威胁动物健康，因此被列为国际动物贸易的重点检疫对象、我国二类动物疫病和我国进口牛、羊必检7种疫病之一。
AKAV属于布尼亚病毒科（Bunyaviridae）正布尼亚病毒属（Orthobunyavirus）辛波（Simbu）病毒血清群，为分节段单股负链RNA病毒，基因组全长12kb，由S、M、L共3个基因节段构成。S基因编码核衣壳蛋白，高度保守；M基因编码病毒囊膜糖蛋白，高度变异；L基因编码具有RNA酶活性的L蛋白，变异程度仅次于M蛋白。根据S、M基因进化分析，可将全球分离到的AKAV分为4个基因型，其中基因I型可分为Ia、Ib两个亚型。
除牛、羊外，AKAV可以感染马、水牛、骆驼，还可以在猪、兔、野牛、河马、长颈鹿、大象、大羚羊等十几种家畜、野生动物中检出AKAV抗体。2016年申请人在竹鼠中分离到新型阿卡斑病毒并申请中国专利（“用于检测新型竹鼠源阿卡斑病毒的RT-PCR引物及其试剂盒”，专利号ZL201710372744.X，公开日2017.05.24），该研究证实与传统毒株相比，该毒株发生一定程度变异，临床症状也有变化，说明新型阿卡斑病毒在宿主范围和致病力上发生改变。随后，云南、广东、湖南、海南等省相继在牛、蠓虫、中华按蚊、致倦库蚊中发现与新型阿卡斑病毒同源性高的AKAV毒株，说明该毒株可能已在一定范围内流行，十分有必要加强对新型阿卡斑病毒的监控。
本发明公开了检测新型阿卡斑病毒M基因的荧光定量RT-PCR引物，包括引物AKAVMF1和引物AKAVMR1，它们分别具有序列表SEQ.ID.No.1和SEQ.ID.No.2的碱基序列。据此，发明人还建立相应的荧光定量RT-PCR检测方法并制备相应的荧光定量RT-PCR试剂盒。实验表明，本发明具有特异、敏感、快速、简便的特点，而且检测灵敏度高，在标准品为1.0×102 ～1.0×1010 copies/µL范围内都有较好的线性关系。本发明检测限低至1.0×102 copies/µL、检测范围宽至9个数量级，灵敏度是普通RT-PCR的107倍，可以从拷贝数低的样品中快速、高效检测新型阿卡斑病毒，满足动物疫病监测、防控的需求，填补了目前临床新型阿卡斑病毒荧光定量检测方法空白，具有较好的应用前景。
