细菌研究室的前身为成立于1960年的流行病研究室下设的细菌组，1980年改称细菌研究室至今。研究室人员现有科技人员18人，其中正高级职称4人、副高职称6人、中级职称4人、初级职称4人。博士研究生学历2人，硕士研究生学历14人；在读博士研究生5人。5人有美国、澳大利亚进修经历。
研究室主要从事动物疫病防控和替抗生物制剂开发研究。先后承担了国家水禽产业体系南宁综合试验站建设、农业部公益性行业项目、广西创新驱动发展专项、广西重点研发计划、广西自然科学基金等重要科技项目。目前在研项目28项，包括省部级项目7项、市厅级项目10项、其他项目11项。近年来，获国家农牧渔业丰收奖二等奖1项、广西科学技术进步三等奖6项；授权发明专利12件；制定地方标准7项；发表论文70余篇，其中SCI论文24篇。科技成果转化10余项，总金额达200多万元。
